MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-USMARC-183

Total Repeats: 44995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_020833	GAT	2	6	311625	311630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332811
5003	NC_020833	CAC	2	6	311636	311641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332811
5004	NC_020833	A	7	7	311683	311689	100 %	0 %	0 %	0 %	472332811
5005	NC_020833	TAA	2	6	311697	311702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332811
5006	NC_020833	T	7	7	311799	311805	0 %	100 %	0 %	0 %	472332812
5007	NC_020833	TCA	2	6	312032	312037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332812
5008	NC_020833	ACAG	2	8	312079	312086	50 %	0 %	25 %	25 %	472332812
5009	NC_020833	T	6	6	312169	312174	0 %	100 %	0 %	0 %	472332812
5010	NC_020833	TGC	2	6	312211	312216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332812
5011	NC_020833	TTA	2	6	312305	312310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332812
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5013	NC_020833	CGT	2	6	313011	313016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332813
5014	NC_020833	CGT	2	6	313074	313079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332813
5015	NC_020833	GT	3	6	313117	313122	0 %	50 %	50 %	0 %	472332813
5016	NC_020833	CCG	2	6	313223	313228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472332813
5017	NC_020833	GCC	2	6	313404	313409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472332813
5018	NC_020833	GTT	2	6	313411	313416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332813
5019	NC_020833	GT	3	6	313510	313515	0 %	50 %	50 %	0 %	472332813
5020	NC_020833	AAC	2	6	313620	313625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332813
5021	NC_020833	GGCT	2	8	313632	313639	0 %	25 %	50 %	25 %	472332813
5022	NC_020833	AGA	2	6	313736	313741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332813
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5025	NC_020833	TCT	2	6	313821	313826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332813
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5033	NC_020833	AAAG	2	8	314370	314377	75 %	0 %	25 %	0 %	472332814
5034	NC_020833	AAAATA	2	12	314394	314405	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	472332814
5035	NC_020833	A	6	6	314409	314414	100 %	0 %	0 %	0 %	472332814
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5038	NC_020833	TAGA	2	8	314513	314520	50 %	25 %	25 %	0 %	472332815
5039	NC_020833	TAGA	2	8	314533	314540	50 %	25 %	25 %	0 %	472332815
5040	NC_020833	CTA	2	6	315200	315205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332816
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5043	NC_020833	TTGGG	2	10	315454	315463	0 %	40 %	60 %	0 %	472332816
5044	NC_020833	ATTG	2	8	315560	315567	25 %	50 %	25 %	0 %	472332816
5045	NC_020833	TGT	2	6	315643	315648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332816
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5051	NC_020833	GCTG	2	8	315913	315920	0 %	25 %	50 %	25 %	472332816
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5057	NC_020833	CAT	2	6	316132	316137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332817
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5059	NC_020833	TGT	2	6	316177	316182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332817
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5062	NC_020833	ATC	2	6	316263	316268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332817
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5087	NC_020833	AATCA	2	10	317777	317786	60 %	20 %	0 %	20 %	472332818
5088	NC_020833	CGCT	2	8	317802	317809	0 %	25 %	25 %	50 %	472332818
5089	NC_020833	A	6	6	317997	318002	100 %	0 %	0 %	0 %	472332818
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5106	NC_020833	T	6	6	318962	318967	0 %	100 %	0 %	0 %	472332822
5107	NC_020833	CCA	2	6	319004	319009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332822
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5109	NC_020833	CAGC	2	8	319085	319092	25 %	0 %	25 %	50 %	472332822
5110	NC_020833	T	6	6	319118	319123	0 %	100 %	0 %	0 %	472332822
5111	NC_020833	A	6	6	319160	319165	100 %	0 %	0 %	0 %	472332822
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5123	NC_020833	ATT	2	6	319838	319843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332823
5124	NC_020833	GAG	2	6	319882	319887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472332823
5125	NC_020833	ATC	2	6	319985	319990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332824
5126	NC_020833	CTG	2	6	320016	320021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332824
5127	NC_020833	TTGC	2	8	320023	320030	0 %	50 %	25 %	25 %	472332824
5128	NC_020833	AT	3	6	320032	320037	50 %	50 %	0 %	0 %	472332824
5129	NC_020833	TCA	2	6	320056	320061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332824
5130	NC_020833	GGT	2	6	320154	320159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332824
5131	NC_020833	ATC	2	6	320229	320234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332824
5132	NC_020833	ATG	2	6	320254	320259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332824
5133	NC_020833	CATTG	2	10	320277	320286	20 %	40 %	20 %	20 %	472332824
5134	NC_020833	GCC	2	6	320296	320301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472332824
5135	NC_020833	AACC	2	8	320501	320508	50 %	0 %	0 %	50 %	472332824
5136	NC_020833	CAC	2	6	320529	320534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332824
5137	NC_020833	AAT	2	6	320712	320717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332824
5138	NC_020833	CAT	2	6	320841	320846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332824
5139	NC_020833	TTGGAT	2	12	320871	320882	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	472332824
5140	NC_020833	TTTG	2	8	320966	320973	0 %	75 %	25 %	0 %	472332824
5141	NC_020833	GAT	2	6	321240	321245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332825
5142	NC_020833	CAG	2	6	321300	321305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332825
5143	NC_020833	AG	3	6	321324	321329	50 %	0 %	50 %	0 %	472332825
5144	NC_020833	CAC	2	6	321339	321344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332825
5145	NC_020833	GCC	2	6	321408	321413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472332825
5146	NC_020833	TGGC	2	8	321444	321451	0 %	25 %	50 %	25 %	472332825
5147	NC_020833	T	6	6	321467	321472	0 %	100 %	0 %	0 %	472332825
5148	NC_020833	TAA	2	6	321492	321497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332825
5149	NC_020833	CACCGA	2	12	321506	321517	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	472332825
5150	NC_020833	TGC	2	6	321528	321533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332825
5151	NC_020833	TGA	2	6	321540	321545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332825
5152	NC_020833	CGG	2	6	321575	321580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332825
5153	NC_020833	GC	3	6	321619	321624	0 %	0 %	50 %	50 %	472332825
5154	NC_020833	GGC	2	6	321725	321730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332825
5155	NC_020833	CGC	2	6	321830	321835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472332825
5156	NC_020833	CCA	2	6	321872	321877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332825
5157	NC_020833	ATG	2	6	321955	321960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332825
5158	NC_020833	AGG	2	6	321982	321987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472332825
5159	NC_020833	ATA	2	6	322096	322101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332825
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5162	NC_020833	CTT	2	6	322388	322393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332826
5163	NC_020833	TCA	2	6	322448	322453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332826
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5165	NC_020833	T	6	6	322542	322547	0 %	100 %	0 %	0 %	472332826
5166	NC_020833	CG	3	6	322568	322573	0 %	0 %	50 %	50 %	472332826
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5176	NC_020833	CTG	2	6	323138	323143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332827
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5184	NC_020833	GCCT	2	8	323665	323672	0 %	25 %	25 %	50 %	472332827
5185	NC_020833	GTC	2	6	323729	323734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332827
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5197	NC_020833	CGCA	2	8	324462	324469	25 %	0 %	25 %	50 %	472332828
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5202	NC_020833	A	9	9	324674	324682	100 %	0 %	0 %	0 %	472332828
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5228	NC_020833	GAAA	2	8	326219	326226	75 %	0 %	25 %	0 %	472332830
5229	NC_020833	TTA	2	6	326244	326249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332830
5230	NC_020833	GGAA	2	8	326312	326319	50 %	0 %	50 %	0 %	472332830
5231	NC_020833	T	6	6	326348	326353	0 %	100 %	0 %	0 %	472332830
5232	NC_020833	ATT	2	6	326376	326381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332830
5233	NC_020833	GTG	2	6	326437	326442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332830
5234	NC_020833	TGC	2	6	326636	326641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332830
5235	NC_020833	TGG	2	6	326690	326695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332830
5236	NC_020833	A	6	6	326762	326767	100 %	0 %	0 %	0 %	472332830
5237	NC_020833	GAA	2	6	326772	326777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332830
5238	NC_020833	TGG	2	6	326840	326845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332830
5239	NC_020833	TCA	2	6	326924	326929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332830
5240	NC_020833	AATT	2	8	327071	327078	50 %	50 %	0 %	0 %	472332830
5241	NC_020833	GAAT	2	8	327110	327117	50 %	25 %	25 %	0 %	472332830
5242	NC_020833	A	7	7	327194	327200	100 %	0 %	0 %	0 %	472332830
5243	NC_020833	CAT	2	6	327220	327225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332830
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5245	NC_020833	GCA	2	6	327281	327286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332830
5246	NC_020833	AGT	2	6	327322	327327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332830
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5250	NC_020833	TAT	2	6	327508	327513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332831
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5363	NC_020833	GT	3	6	334452	334457	0 %	50 %	50 %	0 %	472332839
5364	NC_020833	ACGT	2	8	334627	334634	25 %	25 %	25 %	25 %	472332840
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